【文献検索】PubMedの"Affiliation"（著者所属）フィールドで近接演算ができるようになりました

PubMedの"Affiliation"フィールドで近接演算ができるようになりました。
近接演算とは，「ある検索キーワードの近くに他の検索キーワードが存在する」という
条件で検索ができる機能です。
今までは，"Title"または"Title/Abstract"のみ検索対象として指定できましたが，
"Affiliation"（著者所属）も対象に加わり，表記ゆれが起こりやすい著者所属の検索が
便利になりました。

・近接演算の検索方法

　下記検索式で調べることができます。

　　"複数検索キーワード"[フィールド:~単語数]

　「フィールド」には，"Title"，"Title/Abstract"，"Affiliation"のいずれかを指定します。
　"Affiliation"を指定し，「単語数」が1,000以下の場合は，
　 所属をまたがず，同一の所属内に複数検索キーワードが含まれる文献が検索されます。

・近接演算を使った著者所属の検索例

　佐倉病院の消化器内科に所属している医師が書いた文献を検索したい時，
　"toho university sakura gastroenterology "[Affiliation:~45]  と検索します。
　すると，著者所属に"toho"，"university"，"sakura"，"gastroenterology"の
　4つのキーワードを含み，各キーワード間に含まれる他の言葉が45語以下の文献を
　調べることができます。
　例として，著者所属が以下のような文献がヒットします。

• Division of Gastroenterology and Hepatology, Department of Internal Medicine, Toho University Sakura Medical Center
• Department of Internal Medicine, Division of Gastroenterology and Hepatology, Toho University Sakura Medical Center
• Division of Gastroenterology and Hepatology, Department of Internal Medicine, Toho University Medical Centre, Sakura Hospital

・参考：PubMed Update: Proximity Searching Now Available for Affiliation Search Field. NLM Technical Bulletin. 2023 Jul-Aug
・過去のお知らせ：文献検索情報: 【文献検索】PubMedで近接演算ができるようになりました

【文献検索】PubMedの"Sort by"（並び順の変更）の場所が移動しました

 PubMedの"Sort by"の場所が移動しました。

"Sort by"は，検索結果の並び順を発行日順，筆頭著者名順などに並び替えることができる機能です。
今までは"Display options"の中の1機能でしたが，独立したプルダウンが設置され，素早く検索結果の並び順の変更ができるようになりました。

・"Sort"機能について
　検索結果の並び順を以下のいずれかに変更することができます。
　Best match以外のフィルターは，昇順・降順の選択ができます。
　・Best match：適合度順（デフォルト）
　・Most recent：PubMedにデータが登録された順
　・Publication date：出版年月日順
　・First author：筆頭著者のアルファベット順
　・Journal:雑誌のタイトル順

参考：PubMed Update: "Sort by" Moved Out of Display Options for Quick Access . NLM Technical Bulletin. 2023 Jul–Aug

【文献検索】PubMed【東邦版】の使い方に関するマニュアル（応用編）を公開しました

このたび本ヘルプデスクで， PubMed【東邦版】の使い方を解説するマニュアル
医学メディアセンターブックマークシリーズNo.43「PubMed【東邦版】の使い方 応用編」を作成しました。
　*医学メディアセンターブックマークシリーズは，本学で契約している
　 データベースや電子リソースの使い方，医学メディアセンターのサービスについて
　 解説するシリーズです。

PubMedは海外の医学論文を探す際に重宝する文献検索データベースです。
PubMed【東邦版】は，東邦大学の教職員・学生向けにカスタマイズされたPubMedで，
検索結果に文献の入手を手助けするアイコンが表示されます。
今回のマニュアルは，2021年3月公開の「基礎編」の続編として，応用的な内容を解説するものとなっています。

初めて使う方はまず「PubMed【東邦版】の使い方 基礎編」をご覧ください。

▼ダウンロードはこちらから
「PubMed【東邦版】の使い方 応用編」（PDF 1.64MB）

　※初心者の方はこちら→「PubMed【東邦版】の使い方 基礎編」（PDF 1.41MB）

▼目次
I. 検索式と式の編集

　1. 検索式と自動マッピング

　2. フィールドタグ

　3. 論理演算子と近接演算子
II. MeSHを使った検索
　1. MeSHとは
　2. MeSH Termの調べ方

　3. 調べたMeSH Termを使って検索する

　4. MeSHと自動マッピング

　5. メリットと注意点
III. 参考文献リストをもとに検索する方法
　1. PMID，DOIがわかる場合の検索
　2. Single Citation Matcher
Ⅳ. 臨床医学論文を素早く検索する方法（Clinical Queries）
　1. Clinical Queriesとは

　2. Clinical Queriesを使った，臨床医学領域の論文の検索方法

　3. Clinical Queriesを使った，COVID-19関連論文の検索方法

　4. 検索結果の見方

V. PubMedのマイページ活用

　1. My NCBIとは

　2. My NCBIの登録方法

　3. 検索結果の保存

　4. 検索式の保存とアラート

▼学内関連リンク
・PubMed【東邦版】の概要
・医学メディアセンターブックマークシリーズ

文献検索ヘルプデスクでは個別の文献検索相談にも応じております。
詳しくは下記の問い合わせ先までご連絡ください。

【問い合わせ】
医学メディアセンター文献検索ヘルプデスク
・内線: 2444（医学メディアセンター本館），210（看護学部図書室）

・メール: mnc_search☆ml.toho-u.jp
　※「☆」記号を「@」に置き換えて下さい。

【文献検索】PubMedで近接演算ができるようになりました

PubMedで近接演算ができるようになりました。

近接演算とは，「ある検索キーワードの近くに他の検索キーワードが存在する」という条件で検索ができる機能です。
PubMedでは，以下のような検索式で調べることができます。
検索対象とするフィールドは，"Title"または"Title/Abstract"のみ指定できます。

　"複数検索キーワード"[フィールド:~単語数]

• 近接演算を使った検索例
  例えば，股関節痛について検索したい時，"hip pain"[Title/Abstract:~2]  と検索すると，タイトルか抄録に"hip"と"pain"という2つのキーワードがあり，"hip"と"pain"の間に含まれる他の言葉が2語以下の文献を調べることができます。
  例：hip pain，hip-related pain，pain around the hipなどの言葉が含まれる文献

【文献検索】PubMedの一部フィルターが削除されました

PubMedの絞り込み検索の機能から，以下のフィルターが削除されました 。
以前はこれらのフィルターを選択することで，エイズなどの特定の主題や，
雑誌のジャンルで絞り込みをすることができましたが，利用できなくなりました。

カテゴリ	Filter名
SUBJECT	・AIDS ・Cancer ・Complementary Medicine
JOURNAL	・Dental Journals ・Nursing Journals

図1　削除前のフィルター。

検索結果一覧画面の”Additional Filters”より，追加して利用ができました。

（出典：https://www.nlm.nih.gov/pubs/techbull/so21/so21_pubmed_queries.html）

図2　削除後（2021年10月18日現在）のフィルター。

SUBJECTカテゴリがなくなり，

JOURNALカテゴリ内のフィルターが“MEDLINE”のみとなりました。

※MEDLINEフィルターを使用すると，

　米国国立医学図書館が運営するデータベースであるMEDLINEに

　収録されている雑誌の文献情報のみに絞り込むことができます。

現在は，"aids[sb]"のように検索式を手入力することで
フィルター検索することが可能ですが，
12月初旬には手入力でも検索ができなくなります。
詳しくは下記NLMからのお知らせをご覧ください。

・Updates on PubMed and NLM Catalog Filters and Subsets. 
　NLM Technical Bulletin. 2021 Sep–Oct
　https://www.nlm.nih.gov/pubs/techbull/so21/so21_pubmed_queries.html

【問い合わせ】

医学メディアセンター文献検索ヘルプデスク

・内線: 2444

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【文献検索】PubMed Clinical Queriesの検索方法について

PubMed Clinical Queriesは，PubMedにある臨床医学領域の論文のみを対象に，
短時間で文献検索を行うことができる検索機能です。
2021年7月に，Clinical Queriesの画面がリニューアルしました。
新しくなったClinical Queriesを使った文献検索の方法をご紹介します。

・臨床医学領域の論文の検索方法

1. 検索ボックスに，検索したいキーワードを入力する。

2. “Filter category”は”Clinical Studies”を選択する。

3. “Filter”で，下記の中から絞り込みたいカテゴリを選択する。
　・Therapy（治療法）　　・Diagnosis（診断） 　・Etiology（病理）
　・Prognosis（予後）　　・Clinical Prediction Guides（臨床予測ガイド）

4. “Scope”で，検索範囲を選択する。
　・Broad（感度の高い検索）
　　幅広く検索することで検索漏れを減らします。
　　一方で，関係のない論文が増える恐れがあります。
　・Narrow（特異度の高い検索）
　　狭く検索することで関係のない論文を減らします。
　　一方で，検索漏れが増える恐れがあります。

各フィルターを選択した時に用いられる検索式については，

下記サイトをご覧ください。

https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/help/#clinical-study-category-filters

・COVID-19関連論文の検索方法

1. 検索ボックスに，COVID-19と掛け合わせて検索したいキーワードを入力する。

2. “Filter category”は” COVID-19”を選択する。

3. “Filter”で，下記の中から絞り込みたいカテゴリを選択する。
　・General（絞り込みなし）　　　　・Mechanism（メカニズム，病理）
　・Transmission（感染）　　　　　  ・Diagnosis（診断）
　・Treatment（治療，臨床研究）　　・Prevention（予防と管理）
　・Case Report（症例報告）　　　　 ・Forecasting（予測）

各フィルターを選択した時に用いられる検索式については，
下記サイトをご覧ください。
https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/help/#covid19-article-filters

・検索結果の見方

検索結果のうち，最新文献5件が表示されます。
文献5件の上下に表示されている“See all results in PubMed”をクリックすると，
PubMedの通常の検索と同じ検索結果一覧画面に移動し，検索結果全てを
閲覧することができます。

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【文献検索】PubMedアップデートのお知らせ（2021年7月-8月）

PubMedのCite機能，「Save/Email/Send to」機能と，

Clinical Queriesがアップデートされました。

・Cite機能

本機能では，文献情報を任意の引用形式で出力することができます。
以前は使用するたびに引用形式を選ぶ必要がありましたが，
前回使用した引用形式が記憶されるようになり，その手間がなくなりました。
引用形式は，ブラウザのデータとCookieがクリアされるまで、設定として記憶されます。

・「Save/Email/Send to」機能

• 「Save/Email/Send to」ボタン

検索結果について，テキストファイルやCSVでの保存（Save)，

メール送信（Email），クリップボード等への保存（Send to） 

を行う機能があります。

以前，これらの機能のボタンは常に検索結果のページの最上部に 

設置されていましたが，保存したい文献のチェックボックスを選択すると， 

画面上部にボタンが表示されるようになりました。

• Email機能

Email機能で今まで一度に送れる文献情報は200件まででしたが，

1,000件まで送信できるようになりました。

200件以上選択して送信した場合は，複数のメールに分割され， 

各Emailの件名には「1 of 5」「2 of 5」とラベルが振られます。

・Clinical Queries

Clinical Queriesは，PubMedにある臨床医学領域の論文のみを対象に，
短時間で文献検索を行うことができる検索機能です。
これまでは，臨床医学系論文に対する検索結果と，

COVID-19に対する検索結果が2列に並んで同時に表示されていました。

しかし，今回のアップデートで検索対象をどちらかに選択する方式となり，

操作がわかりやすく，効率的に検索ができるようになりました。 

　【旧画面のClinical Queries】

　　↓

　【新画面のClinical Queries】

新しくなったClinical Queriesを使った検索方法は，下記お知らせをご覧ください。

・PubMed Clinical Queriesの検索方法について

　https://mncsearch.blogspot.com/2021/09/pubmed-clinical-queries.html

参考：NLM Technical Bulletin. 2021 Jul–Aug 

・PubMed Update: Improvements to Email, Cite, and Save/Email/Send To. 

　https://www.nlm.nih.gov/pubs/techbull/ja21/ja21_pubmed_update.html

・PubMed Update: Clinical Queries Usability Study and Interface Updates

　https://www.nlm.nih.gov/pubs/techbull/ja21/ja21_pubmed_clinical_queries.html

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【文献検索】PubMedのSingle Citation Matcher，Batch Citation Matcherの画面デザインがリニューアルされました

 PubMedのSingle Citation MatcherとBatch Citation Matcherの画面デザインが，
リニューアルされました。
いずれも，雑誌名や巻号などの情報をもとにして文献検索を行う際に，便利な機能です。

・Single Citation Matcher

雑誌名，巻，号，ページなどの情報をフォームに入力し，
文献を検索することができる機能です。
雑誌名は，省略名を入力すると，正式名称が予測変換で表示されます。

・Batch Citation Matcher

複数の文献情報を元に，一括でPMID^*1を検索することができる機能です。

下記形式で記述した文献情報をテキストファイルでアップロードするか，
”Citation strings”に直接入力すると，記載のメールアドレスにPMIDを含む
検索結果が送付されます。

・文献情報の記述形式

　雑誌名（略称可）|発行年|巻|最初のページ|著者名|任意のID|

　　※「任意のID」は，検索には反映されない項目です。

　　　参考文献リストの文献番号など，自分の文献管理用に

　　　好きな数字や文字を入力します。空欄でも構いません。

　　※不明な項目は空欄にし，区切り線のみを入力します。

　記述例：2006年に発行された”Am J Gastroenterol”の100巻に掲載されている，

 　　　　　”Triester SL”による文献（ページ数不明，任意のIDは指定しない）

　　　　　→Am J Gastroenterol|2005|100||Triester SL||

　なお，リニューアル前はPubMed Central ID（PMCID）^*2を検索することが

　できましたが，現在はPMIDの検索のみが可能となっています。

*1 PMID

　PubMedに収録されている全ての文献に付与されている，各文献固有のID番号。

　PubMedでは，PMIDから文献を検索することもできます。

*2 PubMed Central ID（PMCID）

　PubMed Central（PMC）は，PubMedと同じ米国国立医学図書館（NLM）が運営する，

　無料のオンライン文献アーカイブです。PubMed Central ID（PMCID）は，

　PMCに収録の文献に付与されている固有のID番号です。

 ・参考：PubMed Update: Single Citation Matcher and Batch Citation Matcher . 

　　　　 NLM Technical Bulletin. 2021 Mar–Apr

https://www.nlm.nih.gov/pubs/techbull/ma21/ma21_pubmed_single_and_batch_citation_matcher.html

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【文献検索】PubMedのログイン方法が変更になります

PubMedで検索式を保存したり設定のカスタマイズを行う際のログイン方法が，
Googleなど外部サービスのアカウントを用いたログインのみになります。
My NCBI*で登録したユーザーネームとパスワードでログインしている方は，
2021年6月1日以降，ログインすることができなくなります。
対象の方は，アカウントのリンク設定をお願いいたします。

　*NCBI（アメリカ国立生物工学情報センター）が提供するデータベース
（PubMedなど） 共通のマイページ機能

・対象者
MyNCBIに，"NCBI Account"または"Sign in directly to NCBI"からログインしており，
Googleなど外部サービスのアカウントとリンク設定を行っていない方。
※PubMedトップページ右上の"Log in"ボタンをクリックし，ログインする際に,
　"NCBI Account"よりログインする方が対象です。

・設定方法
1. PubMedの右上の"Log in"ボタンをクリックし，"NCBI Account"よりログインします。

2. PubMedの画面に戻ったら，右上のユーザー名をクリックし
　 "Account settings"を選択します。

3. "Linked accounts"に外部サービスのアカウントが表示されているか確認します。
　 ・Googleなどのアカウントの表示がある場合
　 　→この後の設定は必要ありません。
　　　 次回からは，表示されているアカウントを使ってログインしてください。
　・”None”と表示されている場合
　　→アカウントの追加設定が必要です。"Linked accounts"の"Change"ボタンを
　　　 クリックし，下記の手順で作業を進めてください。

4. “All Available Partner Accounts”で，ログインに使いたい
　 外部サービスの名称を検索し，追加します。

　※東邦大学の学内Gmailアカウントでも登録が可能です。
　　 登録の際は，”Google”を選択してください。
　　 ※検索可能なアカウントの中に，"Toho University"もありますが，
　　 　こちらから登録はできませんのでご注意ください。

・参考：Important Changes to NCBI Accounts Coming in 2021.
　　　　NLM Technical Bulletin. 2021 Jan–Feb
　　　　https://www.nlm.nih.gov/pubs/techbull/jf21/jf21_ncbi_login.html

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【文献検索】PubMed【東邦版】の使い方に関するマニュアルを公開しました

このたび本ヘルプデスクで， PubMed【東邦版】の使い方を解説するマニュアル
医学メディアセンターブックマークシリーズNo.38「PubMed【東邦版】の使い方 基礎編」を作成しました。

　*医学メディアセンターブックマークシリーズは，本学で契約している

　 データベースや電子リソースの使い方，医学メディアセンターのサービスについて

　 解説するシリーズです。

PubMedは海外の医学論文を探す際に重宝する文献検索データベースです。

PubMed【東邦版】は，東邦大学の教職員・学生向けにカスタマイズされたPubMedで，
検索結果に文献の入手を手助けするアイコンが表示されます。
今回のマニュアルは，初めてPubMed【東邦版】で英語の論文を検索する方を対象にした基礎編となっています。

今後は，マニュアルの応用編も作成予定です。

▼ダウンロードはこちらから

「PubMed【東邦版】の使い方 基礎編」（PDF 1.41MB）

▼目次

I. PubMedの概要
II. 検索の基本
　1. PubMed【東邦版】の利用方法
　2. キーワード検索
III. 検索結果の見方
　1. 検索結果一覧
　2. 詳細表示
Ⅳ. 論理演算子と検索式
　1. 論理演算子（AND，OR，NOT）を使った検索
　2. Advanced Search Builder
V. 検索結果の絞り込み
　1. Filterを使った絞り込み
2. Filterの追加
　VI. 文献の入手
　1. 文献入手の流れ
　2. 「Link@東邦大学」を使った文献入手

▼学内関連リンク

PubMed【東邦版】の概要
https://www.mnc.toho-u.ac.jp/mc/db_pubmedtoho.php

医学メディアセンターブックマークシリーズ
https://www.mnc.toho-u.ac.jp/mc/mmcbookmark.php

文献検索ヘルプデスクでは個別の文献検索相談にも応じております。
詳しくは下記の問い合わせ先までご連絡ください。

【問い合わせ】

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【文献検索ヘルプデスク】ポスター「PubMed Clinical QueriesでCOVID-19検索」を掲示しました

「PubMed Clinical QueriesでCOVID-19検索」と題したポスターを作成しました。

2020年10月にPubMed Clinical Queries*がリニューアルされ，

新たに新型コロナウイルス感染症（COVID-19）に関する文献の検索に特化した

フィルターが追加されました。

ポスターでは，リニューアルにおける主な変更点と検索方法を簡単にまとめています。

　*Clinical Queriesは，PubMedにある臨床医学領域の論文のみを対象に，
　　短時間で文献検索を行うことができる検索機能です。

医学メディアセンター Communication Square(メディアセンター前の廊下)で
掲示しております。
掲示期間は，2020年12月7日(月)～2021年2月28日(日）を予定しています。

掲示しているポスターのPDF版を以下のURLからダウンロードできます。

こちらもご利用ください。

https://www.mnc.toho-u.ac.jp/mc/doc/mmc/searchposter_20201207.pdf

ポスターの画像サンプル

【文献検索ヘルプデスク】PubMedにおけるCOVID-19の検索

 1. 概要

　PubMedにおける新型コロナウイルス感染症(以下，COVID-19)の検索と注意点について解説します。

2. 検索方法

2-1 検索キーワード

　PubMedでは，“covid-19”と検索ボックスに入力して検索すると，COVID-19に関する文献について網羅的に調べることができます。
画面上は”covid-19”としか表示されていませんが，自動的に下記検索式で検索が行われる仕組みになっているからです。

"severe acute respiratory syndrome coronavirus 2"[Supplementary Concept] OR "severe acute respiratory syndrome coronavirus 2"[All Fields] OR "ncov"[All Fields] OR "2019 ncov"[All Fields] OR "covid 19"[All Fields] OR "sars cov 2"[All Fields] OR (("coronavirus"[All Fields] OR "cov"[All Fields]) AND 2019/11/01:3000/12/31[Date - Publication])

　検索式の解釈は次の通りで，これら7つに該当するものを一度に検索しています。11月10日現在，72,655件の文献がヒットします。

　(1) "severe acute respiratory syndrome coronavirus 2"の統制語*がついた論文

　(2) "severe acute respiratory syndrome coronavirus 2"という用語が
　　　どこかに記載されている論文

　(3) “ncov”という用語がどこかに記載されている論文

　(4) “2019 ncov”という用語がどこかに記載されている論文

　(5) “covid 19”という用語がどこかに記載されている論文

　(6) “sars cov 2”という用語がどこかに記載されている論文

　(7) “coronavirus”または”cov”という用語がどこかに記載された，
　　　2019年11月1日から3000年12月31日までに出版の論文

*統制語とは
　論文に付与されるタグのようなものです。PubMedでは「MeSH」と呼ばれています。
　COVID-19に関連する論文には，その内容によって“severe acute respiratory syndrome coronavirus 2（SARSコロナウイルス2）”，” COVID-19 vaccine（ワクチン）”などの統制語が付与されます（11月10日現在）。
　統制語の一覧は下記URLより確認可能です。
　https://www.ncbi.nlm.nih.gov/mesh/?term=COVID-19

2-2 Clinical Queries

　臨床医学領域の文献を検索することができるPubMed内のツール”Clinical Queries”を使って，COVID-19について検索することもできます。
　検索ボックスにCOVID-19と掛け合わせて検索したいキーワードを入力し，COVID-19 Articlesフィルターで絞り込みたいカテゴリを選択します。
選択できるカテゴリは下記の通りです。

・General（絞り込みなし）　　　　　・Mechanism（メカニズム，病理）

・Transmission（感染）　　　　　　  ・Diagnosis（診断）

・Treatment（治療，臨床研究）　　　・Prevention（予防と管理）

・Case Report（症例報告）　　　　　・Forecasting（予測）

　各フィルターを選択した時に用いられる検索式については，下記サイトをご覧ください。
　https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/help/#covid19-article-filters

 

3. プレプリントについて

　PubMedでCOVID-19について検索すると，雑誌に掲載の論文だけでなく，
プレプリントも検索結果に含まれます。
　PubMedを運営する米国国立医学図書館（以下，NLM）の論文アーカイブサイト，
PMCにCOVID-19に関する一部のプレプリントが収録されているため，
PubMedで検索するとヒットするようになっています。
　プレプリントとは，査読を通過する前の論文のことです。プレプリントの見分け方や検索結果から除外する方法については，下記お知らせをご確認下さい。

・文献検索情報: 【文献検索ヘルプデスク】PMCに新型コロナウイルスに関するプレプリントが収録されました

5. 医中誌におけるCOVID-19の検索

　国内のCOVID-19関連の論文を調べる際は，医中誌Webを使用してください。医中誌WebにおけるCOVID-19の検索については，次の記事でまとめています。
　https://mncsearch.blogspot.com/2020/11/webcovid-19.html

******

東邦大学医学メディアセンター文献検索ヘルプデスク

mnc_search☆ml.toho-u.jp

※「☆」記号を「@」に置き換えて下さい。

【文献検索ヘルプデスク】PubMedアップデートのお知らせ（2020年9-10月）

PubMedのPublication Dateフィルターと，Clinical Queriesページが
アップデートされました。

・Publication Dateフィルター
　Publication Dateフィルターは，PubMedで検索した後の検索結果一覧に
　おいて，左側に表示されるフィルターの1つです。
　検索結果を出版年で絞り込みすることができます。
　これまでのPubMedでは，1year，5years，10yearsの選択肢しか
　ありませんでした。
　しかし，アップデート後はCustom Rangeの項目が追加され，自分で
　出版年月日を範囲指定して絞り込みができるようになりました。

・Clinical Queries
　PubMedにある臨床医学領域の論文のみを対象に検索することができます。

　今回アップデートされたのは下記3点です。

1.   画面デザインのリニューアル

　　New PubMedと同じ画面デザインになりました。

　

2.　COVID-19 Articles
　　新型コロナウイルス感染症に関する文献について，治療，症例など
　　カテゴリ別に絞り込みをして検索することができる機能が追加されました。

　

3.　Systematic Reviewsフィルター，Medical Geneticsフィルターの削除
　　以前はトップページの検索ボックスの下にあるフィルターを用いて
　　システマティックレビューのみ，また遺伝医学に関わるトピックで
　　文献を絞り込み検索することができましたが，トップページから
　　これらのフィルターがなくなり，絞り込みの方法が変わりました。

　　システマティックレビューに絞り込みたい場合は， 検索後，
　　"See all"をクリックすると表示される検索結果一覧の画面で，
　　Article Typeフィルターの”Systematic Review”をクリックします。
　

　　遺伝医学に関わるトピックで絞り込みをしたい場合は，検索ボックスに
　　"フィルター名[Filter]"と手入力し，キーワードと掛け合わせて検索します。
　　例えば，"sickle cell anemia（鎌状赤血球貧血）"について，
　　"genetic counseling（遺伝カウンセリング）"で絞り込みを行いたい時は
　　下記のように入力して検索します。
　　　sickle cell anemia AND genetic counseling[Filter]

　　検索に用いることができるMedical Geneticsフィルターは以下の通りです。
　　　・Diagnosis
　　　・Differential Diagnosis
　　　・Clinical Description
　　　・Management
　　　・Genetic Counseling
　　　・Molecular Genetics
　　　・Genetic Testing
　　　・Medical Genetics
　　Medical Geneticsフィルターについて，詳しくはこちらをご覧ください。

【文献検索ヘルプデスク】10月31日にlegacy PubMedが廃止されます

10月31日に，PubMedの旧バージョン(legacy PubMed)が

廃止されることが発表されました。

PubMedは昨年11月より新しいバージョン(New PubMed)が利用可能となり，
今年5月からはNew PubMedがデフォルトとなっています。

10月23日現在はlegacy PubMedも並行して利用可能となっていますが，
10月31日以降は利用ができなくなります。

詳しくは下記サイトをご覧ください。

・NCBI Insights : New PubMed updates and retirement of legacy PubMed on October 31
　https://ncbiinsights.ncbi.nlm.nih.gov/2020/10/21/legacy-retired/

参考：NCBI RSS Feed: PubMed New and Noteworthy

　　　（PubMedのアップデート最新情報）
　　　https://www.ncbi.nlm.nih.gov/feed/rss.cgi?ChanKey=PubMedNews

文献検索ヘルプデスクでは，PubMedのアップデート情報を
随時情報発信していますので，ぜひご覧ください。

・東邦大学メディアセンターヘルプデスク文献検索情報: PubMed

　https://mncsearch.blogspot.com/search/label/PubMed

また，検索に関する悩み・疑問がありましたら，お気軽にご相談ください。
個別対応のほか，グループで受講する講習会の開催もご相談いただけます。

相談申込方法はこちら

【文献検索ヘルプデスク】PubMedの追加アップデート内容が発表されました

MLA2020(米国医学図書館協会の年次大会)にて，PubMedの追加アップデート内容について発表がありました。

【9月2日現在，既に実装されているもの】

・検索結果の並び順を，筆頭著者名順や雑誌名順に変更できるようになりました。

・検索結果一覧に，スニペット*を表示しないオプションが追加されます。
　　*文献のアブストラクトから,検索キーワードに関連が深い部分を抜粋したもの。

・検索結果を出力する際の表示形式で，PMID一覧やPubMed形式(旧・MEDLINE形式)が
　選択できます。

【今後予定されているアップデート】

・Clinical Queries*ページがリニューアルされます。

　 *PubMedの関連サービスの1つ。
　　PubMedにある臨床医学領域の論文のみを対象に検索することができます。

・検索結果画面のフィルターのメニューに，日付を範囲指定して絞り込みを行う
　フィルターが追加されます。

・旧PubMedの詳細表示画面にあった，Related Information機能が逐次追加されます。
　関連する文献や，MedGen*に収録されている関連情報へのリンクなどが設置予定です。
 　*PubMedと同じく，NLM(米国国立医学図書館)が提供するデータベース。
　　人間の遺伝性疾患や，遺伝子の表現型に関する情報を検索することができます。

・MyNCBIに，以下の機能が追加されます。

　- 検索結果画面で，文献情報の中の検索タームを任意の色や太字でハイライトする
　　ことができるようになります。

　- 複数のリンクリゾルバを設定することができるようになります。
　　例えば東邦大学と他の大学で勤務している場合，検索結果に「Link@東邦大学」と
　　他の大学の文献入手のためのリンクアイコン両方を表示させることができます。

MLA2020は，新型コロナウイルス感染拡大防止のためオンラインでの開催となりました。

追加アップデートについて発表があった"PubMed Update - Medical Library Association (MLA) 2020 Virtual Conference"は動画配信となっています。
動画では，昨年11月に新しいPubMedが公開されてから現在までに追加された，上記以外の機能も紹介しています。

また，”MLA 2020: National Library of Medicine Updates”では，動画の内容をPowerPoint形式でダウンロードすることができます。
ぜひご活用ください。

【文献検索ヘルプデスク】PMCに新型コロナウイルスに関するプレプリントが収録されました

PMC(米国国立医学図書館（NLM）が運営する，無料の論文アーカイブサイト)に，
新型コロナウイルスに関するプレプリント*が収録され，PubMedでも検索できる
ようになりました。
これは，NLMのプレプリントの利用に関する試行プロジェクト，
"NIH Preprint Pilot"によるものです。
現在は，プロジェクトの第1段階にあたります。新型コロナウイルスに関する
出版物やプレプリントをまとめた"iSearch COVID-19 Portfolio"のうち，
著者がNIH所属，またはNIHから支援を受けている研究のプレプリントが
PMCに収録されています。

・プレプリントの見分け方
　プレプリントは，PubMedの検索結果の画面では，DOIの後ろに
　"Preprint"と表示されています。
　詳細表示画面では，上部に"This article is a preprint"という
　緑色のサインが表示されます。
　タイトル上部には，査読前の論文のため，収録雑誌名ではなく
　掲載されているプレプリントサーバー名が記載されています。
　現在PubMedで検索できるプレプリントは全てPMCに収録されているため，
　"PMC Full text"アイコンより無料で閲覧可能です。

・PubMedでの検索について

　プレプリントは，「preprint[pt]」という検索式を使用するか，

　検索結果画面のフィルターでArticle typeを「Preprint」に絞り込むことで

　検索することができます。

　検索結果からプレプリントを除外したい場合は，「Advanced Search Builder」で

　任意の検索式と「preprint[Publication Type]」をNOTで掛け合わせて検索します。

　詳しくは，PubMed【東邦版】の使い方をご覧ください。

 *プレプリント：査読を通過する前の論文のこと。プレプリントをアップロードし

　　　　　　　　公開するためのインターネット上のサーバーを「プレプリント

　　　　　　　　サーバー」と呼びます。

　　　　　　　　今回収載対象となった"iSearch COVID-19 Portfolio"には，

　　　　　　　　新型コロナウイルスに関する論文の多いプレプリントサーバー

　　　　　　　　（medRxiv，bioRxiv，ChemRxiv，arXiv，Research Square，

　　　　　　　　SSRN）にアップロードされたプレプリントが収録されています。

　　　　　　　　プレプリントの公開は，論文投稿後迅速に研究成果が共有できる，

　　　　　　　　世界中の研究者が無料で論文を閲覧できる，著者が研究の先取性を

　　　　　　　　確保できるなどのメリットがあります。一方で，原稿の質の確認を

　　　　　　　　行うことが難しいという課題もあります。

【文献検索ヘルプデスク】臨床家向けのPubMedの教材が公開されました

PubMedのオンライン教材"Using PubMed in Evidence-Based Practice"が，
PubMedを運営するNLM（米国国立医学図書館）のWebサイトで公開されました。
PICOを使って臨床上の疑問を定式化し，効率的にPubMedで関連文献を調べる
方法を学ぶことができます。
臨床現場で働く医師や看護師，コメディカル向けの教材で，
30分未満で学べる内容となっています。
下記URLよりご利用ください。

・Using PubMed in Evidence-Based Practice
　 https://www.nlm.nih.gov/oet/ed/pubmed/pubmed_in_ebp/index.html

PubMedの基本的な検索方法や検索の仕組みについて学ぶことができる，
PubMed Essentialsもあわせてご活用下さい。

【文献検索ヘルプデスク】PubMed Essentials(オンライン教材)が公開されました

New PubMedのオンライン教材"PubMed Essentials"が，
PubMedを運営するNLM（米国国立医学図書館）のWebサイトで公開されました。
学生や医療従事者，研究者向けに，1回1～4分程度で学べる内容となっています。
9つのチュートリアルから構成されており，New PubMedの基本的な検索方法や，
検索の仕組みについて学ぶことができます。
　
PubMed Essentialsは，PubMed Online Trainingの"Quick Tours(New PubMed)"
よりご利用いただけます。
　
9つのチュートリアルは以下の通りです。
ぜひご活用ください。

・What is in PubMed?	3 min(s)
・PubMed: Find articles on a topic	1 min(s)
・PubMed subject search: How it works	4 min(s)
・PubMed: Find articles by author	2 min(s)
・PubMed: Find articles from a citation	2 min(s)
・PubMed: Find articles by journal	2 min(s)
・PubMed: Find the latest treatments for a disease or disorder	2 min(s)
・PubMed: Get the full text for an article*	2 min(s)
・PubMed: Save searches and set e-mail alerts	2 min(s)

*New PubMed【東邦版】を利用した文献入手方法については，こちらをご覧ください。

【文献検索ヘルプデスク】ポスター「New PubMedの変更点と新機能」を掲示しました

「New PubMedの変更点と新機能」と題したポスターを作成しました。
2019年11月に利用可能となったPubMedのリニューアル版（New PubMed）の，
主な変更点，新機能，従来通りの点をまとめています。
医学メディアセンター Communication Square(メディアセンター前の廊下)で掲示しております。

掲示期間は，2020年2月25日(火)～2020年6月30日(火）です。

掲示しているポスターのPDF版を以下のURLからダウンロードできます。
こちらもご利用ください。
https://www.mnc.toho-u.ac.jp/mc/doc/mmc/searchposter_20200225.pdf

ポスターの画像サンプル

【文献検索ヘルプデスク】リニューアルされたPubMedを紹介します

更新日:2020年1月9日

2019年11月18日にPubMedのリニューアル版(以下，New PubMed)が利用可能になりました。
このお知らせではアップデートの概要や変更点について簡単にご紹介します。

■ 目次

• 概要
1. デザインの変更と検索機能の強化
2. New PubMedへの正式な移行は2020年春以降
3. legacy PubMedとNew PubMedの切替に注意
4. 関連するサービスのアップデートは未定
• New PubMedの紹介
1. 主な変更点
2. その他の変更点
• お問合わせ

■ 概要

デザインの変更と検索機能の強化

New PubMedは増加するスマートフォンやタブレットからのアクセスに対応し，画面サイズによって画面レイアウトが変わるレスポンシブデザインを採用しました。
また機械学習技術を応用した検索機能の精度向上やフィルター機能の利便性向上など検索機能が強化されました

New PubMedへの正式な移行は2020年春以降

現在は従来のPubMed(以下，legacy PubMed)とNew PubMedの両方が利用できます。
正式な移行は2020年春を予定しており，それ以降はNew PubMedしか利用できなくなります。

legacy PubMedとNew PubMedの切替に注意

legacy PubMedとNew PubMedはPubMedの画面上にあるバナーをクリックすることで切り替えが可能です。
しかしこのバナーで切替を行った場合，当センターの提供する文献入手のための各種支援が利用できなくなります。
バナーを使ったlegacy PubMed⇔New PubMedの切り替えは推奨しません。

legacy PubMedおよびNew PubMedの切り替えや，両PubMedへのアクセスは下記のURLから行ってください。
このリンク先は東邦大学専用にカスタマイズされたPubMedになっています。
通常のPubMedと異なり，本学が契約する電子ジャーナルへのアクセスや当センターの所蔵状況の参照が可能です。

• legacy Pubmed【東邦版】
• New PubMed【東邦版】

合わせて以下もご覧ください⇒　電子リソース情報: New PubMedのお知らせ

関連サービスのアップデートは未定

アップデートされたのはPubMedのみです。
関連サービスである「Crinical Query」や「MeSH Database」，「Single Citation Matcher」などにデザインや機能の変更はありません。また今後のアップデートも現在のところ予定されていません。

■ New PubMedの変更点

主な変更点

今回のアップデートの主な変更点として次の3つを挙げます

• スマートフォンやタブレットなど様々な画面サイズに対応し，自動で見やすい表示に切り替わる仕組み(=レスポンシブデザイン)が採用された。
  


• 検索結果のソート方法の標準が変更されました。新しい文献順に検索結果を並べる「Most Recent」が従来の標準でしたが，今回のアップデートでlegacy PubMedとNew PubMedの両方で，検索式に対する論文の関連度の順に検索結果を並べる「Best Match」が標準となっています。
  
• 検索結果の画面が洗練され使いやすくなりました。
  

その他の変更点

PubMedの提供元である米国国立医学図書館(NLM)が各変更点についてまとめています。詳しくは下記のページをご確認ください。

https://www.nlm.nih.gov/pubs/techbull/nd19/nd19_pubmed_new.html (英語)
また動画やパワーポイントも提供されています。
以下のURLからアクセスすることができます。
https://www.nlm.nih.gov/oet/ed/pubmed/events/2019_09.html (英語)

■ お問合わせ

当センターでは文献検索のヘルプデスクを設置しております。
新しいPubMedに関することだけでなく，文献検索全般に関する支援を行っております。
詳しくは以下をご覧ください。

https://www.mnc.toho-u.ac.jp/mc/mnc_search.php

【文献検索ヘルプデスク：問い合わせ】
内線：
・大森地区：2444，2449 平日9-17時
・看護学部：210 平日9-17時
メール：mnc_search☆ml.toho-u.ac.jp
　　※「☆」記号を「@」に置き換えて下さい。